Cochran Q检验是一种非参数统计方法，用于比较三个或更多相关样本中的二分类变量（如成功/失败、通过/未通过等）的比例。Cochran Q检验是Friedman检验在二分类情况下的特殊情况，它主要应用于重复测量设计或随机区组设计。Cochran Q检验旨在检测在不同条件下，受试者的二分类响应是否存在显著差异。
假设对比三种不同的止痛药对慢性头痛患者缓解症状的效果。随机选择了20名诊断为慢性头痛的患者。为了比较三种止痛药的效果，将每个患者分配到三个阶段的治疗，每个阶段为2周，中间有一个为期2周的洗脱期。三种止痛药包括：止痛药A、止痛药B、止痛药C。在每个阶段结束时，记录患者的头痛症状是否得到有效缓解(成功或失败)。1表示成功，0表示失败。表格中是收集到的数据。
为了确定三种止痛药的疗效有无显著性差异，可以使用Cochran Q检验计算Q值和P值。如果P值小于预先设定的显著性水平(例如0.05)，就可以拒绝H0(所有止痛药的疗效相同)，并得出结论：至少有一种止痛药的疗效与其他止痛药不同。
通过Cochran Q检验，发现止痛药存在显著差异（Q = 8，df = 2，p < 0.05）。进一步的多重比较分析显示，止痛药C的有效率（80%）显著高于止痛药A和止痛药B。